
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原聚集MHC简述通过肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽队列还有当地翻译后掩盖信息查询,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头开始测序能力,不依赖现有数据库,更大通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且非常丰富的数据资料解析信息为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递淋巴肿瘤抗原的路线
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典型案例阐述
01 机制化深入分析
论文填空题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
撤稿自媒体:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)有的是种核输送核蛋白,在胃癌中总是过表达方式,逐项为肿癌发生的的驱程关键因素。现如今,靶点XPO1的小团伙正被用于临床实践防癌药物治疗。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫性肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 这种原自XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 肿癌-免役开展
原创文章主题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
发表过杂志网站:Nature Communications IF:16.6 2023
梭形血细胞肿癌胸膜间皮瘤(MPM)也是种药用价值异常情况的侵扰性肿癌。致使替换成的调理工作方案缺失药用价值,如此迫在眉睫必须 新的调理攻略。由此可见其T血细胞侵润性,创作者选用MPM也是个比较好的调理性癌病预防针的对方。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用依据质谱的免疫系统肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤抗体肽组学的检测
03 疾病mRNA预防针定制开发
内容小题目:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
发布报纸:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过研究背景质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌细菌感染的Hela上皮細胞和HCT-116上皮細胞中认定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人总结
天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系肽组学是淀粉酶质组学的一款高效的发展的分枝,它专心于深入分析天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系软件中由主要组织化开展相匹配性分手后复合体(MHC)或人类白肿瘤体人体细胞系系抗原(HLA)分子结构呈递的天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系肽。某些天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系肽是肿瘤体人体细胞系系界面呈递的肽段,要能被T肿瘤体人体细胞系系辨认,以此激发天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系反响。对于质谱的天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系肽组学已是成了检测MHC淀粉酶呈递肽的金原则的办法,要能可以直接检测有所差异生理问题和方面的问题感觉下有所差异组织化开展和肿瘤体人体细胞系系方式中的天然免疫系统力检测检测力肿瘤体人体细胞系系肽组,列如实物瘤或病毒是什么沾染的肿瘤体人体细胞系系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫抗体肽组检侧服务性,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,并能正确且间接出具免疫性系统肽字段,察觉越来越多非基本特征免疫性系统肽,逐层筛分出靠得住新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参照资料
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y