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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核海洋生物学mRNA中最终要的转录后掩盖,在真核海洋生物学的传染病症和生理上的时候中起着至关极为重要的效用。糖尿病的风险的认知功能障碍都是种不可逆性的中枢设备周围神经设备退行性传染病症,现今发展前景更何况切措施已经截然确立,还有存在很好的有效防范和中药治疗方式。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱动物为其提供m6A甲基化解析科技服务质量,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

好文章英文名称:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

玩家工作单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

钻研的材料:小鼠脑组织

拜谱给予技木:m6A甲基化(MeRIP-seq)

小结图:

图1| 英文论文图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

探索然而

1.DCI小鼠海马中m6A基因遗传呈现的转换

科研技术人士第一建立起了高脂饮食文化和判断能力困难(DCI)的小鼠型号。为特别差表组(n = 3)和DCI组(n = 3)直接的m6A遗传遗传遗传基因绘制,科研技术人士便用MeRIP-seq参与了转录组范围图内的m6A-seq浅析。在DCI组的10664个编号遗传遗传遗传基因转录物(mRNAs)中共中央发掘差表组的23718个不叠加的m6A峰。优于的情况下,DCI组行为出23,758个非叠加m6A峰。里面,934几个甲基化遗传遗传遗传基因在差表组和DCI组直接叠加(图2)。

图2| 对应组和DCl组m6a体现表观遗传的维恩图

共鉴定会出127九个不一致性甲基化的m6A位点(DMMSs),这其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化平均水平各用可观过于比对组。介绍其布局条件发掘m6A峰布局在一整个RNA中(图3A),并可根据其布局的转录区主要包括这五组:5'UTR、3'UTR、转录开始和结束位点区精彩细节描写、中止账户密码忘了忘了子精彩细节描写、开始和结束账户密码忘了忘了子精彩细节描写和项目编码回文序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和中止账户密码忘了忘了子附过可观生物富集(图3B)。从而分析他们DNA上m6A体现的区,探究成员挑选了有峰标注的区,并检测了他们DNA上reads的涵盖率。在DCI组中,m6A体现区摇摆不定于3'UTR区(图3C)。其它mRNA内的DMMS都被市场定位到固色体去分析其布局情况。与众区别小鼠固色体的m6A体现谱与众区别。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的发生变化

方便测试m6A呈现在DCI小鼠中的生命科学学效果,探析人工从2组数中择含DMMS的蛋清质编号dna参与GO和KEGG浅析(图4A)。在GO浅析中,高甲基化dna在生殖体細胞工作、生命科学工作干预、崔化可溶性和杂环氧化物搭配中同质性含有。KEGG径路浅析提示,高甲基化dna与T生殖体細胞感觉讯号径路、小生殖体細胞癌症和RIG-I样感觉讯号径路一些(图4B)。谈谈低甲基化dna,GO浅析提示在生殖体細胞工作、分解工作和搭配工作中同质性含有无机环氧化物、搭配杂环氧化物和崔化可溶性(图4C)。KEGG径路浅析体现了低甲基化dna与肥厚性心肌病和Hippo讯号径路的关系(图4D)。

图4| 相互影响甲基化m6A位点的通道生物富集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq大数据的整合深入分析

随着理论研究技术人员将m6A MeRIP-Seq的动态数据库和原先RNA-Seq的动态数据库确定整合介绍,展示163个mRNA,m6A峰和mRNA技术关卡有效变更。41种mRNA的m6A和mRNA技术关卡上浮,14种mRNA技术关卡调低。不仅如此,30个染色体组mRNA理解上浮,m6A技术关卡调低,74个染色体组mRNA理解调低,m6A技术关卡上浮(图5A)。在最后,营造了了个PPI系统来展示163个染色体组商品编号的淀粉酶相互间的连入(图5B)。

如图已知6已知,GO和KEGG分折氛围四组:(1) m6A上浮,mRNA调低;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A调低,mRNA调低;(4) dnam6A调低和mRNA上浮。在GO分折中,m6A上浮和mRNA调低的dna在生殖脑神经生殖细胞核基础分解分解新陈细胞分解率步骤中 、幽香族有机化合物生物工程合并步骤中 和RNA基础分解分解新陈细胞分解率步骤中 的调节作用中可观含有。KEGG分折凸显,这一些dna在皮下脂肪多酸基础分解分解新陈细胞分解率、小生殖脑神经生殖细胞核非小脑神经生殖细胞肺癌、丙酸基础分解分解新陈细胞分解率和异丙醇酸基础分解分解新陈细胞分解率中含有。针对于m6A上浮和mRNA上浮的dna,GO分折凸显在亚铁紧密融入、亚胺丙氨酸脱羧酶特异性、天冬氨酸1-脱羧酶特异性和生殖脑神经生殖细胞核连结制造负调节作用中含有;KEGG分折凸显在2型高血压、皮下脂肪多生殖脑神经生殖细胞核指数数字预警通道和胰岛素数字预警通道中含有。在GO分折中,m6A调低和mRNA调低的dna在寡肽紧密融入、谷胱甘肽紧密融入和二硫阳极非金属氧化物物阳极氧化物呈现酶特异性中含有,而在KEGG分折中,鸟卵在青金桔酸循坏往复(TCA循坏往复)、丙酸基础分解分解新陈细胞分解率和多鱼类凋亡中含有。在GO分折中,m6A调低和mRNA上浮的dna在胚胎骨软骨特征发生了、血清激酶特异性重置和NADP基础分解分解新陈细胞分解率步骤中 中含有,在KEGG分折中,m6A调低和mRNA上浮dna在新霉素、卡那霉素和脑神经影响指数数字预警通道中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA表答的联和分享

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG剖析

拜谱生物工程总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生态学提供了m6A甲基化新服务质量,拜谱生态学可提供完善成熟的蛋白酶组学、分解代谢组学、转录组学及其几组学整合物品技巧服務,欢迎致电咨询!

分类文献综述:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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